双峰驼CYP2J cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析

• 作者: 哈斯苏荣 彭小彬 罗查干 贾志鹏
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 双峰驼 CYP2J 生物信息学分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 2133-2144
• 页数: 12页
• 分类号: S824.2
• 字数: 5367字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.10.009

摘要

旨在研究双峰驼CYP2J基因及其编码蛋白的结构和功能.本试验首先通过RACE和RT-PCR技术,扩增得到双峰驼CYP2J基因cDNA全长.然后利用生物信息学方法,对该基因编码的蛋白特征进行分析,并使用MEGA 6软件构建双峰驼CYP2J蛋白与相关物种CYP2J蛋白的进化树.最后利用实时荧光定量PCR测定CYP2J基因在双峰驼各组织的表达量差异.结果表明,双峰驼CYP2J基因cDNA全长为1 770 bp,其中完整开放阅读框(ORF)为1 509 bp,共编码502个氨基酸.生物信息学分析结果表明,其ORF编码的蛋白为一种稳定的亲水性蛋白,且不具有信号肽识别功能,但有一个跨膜区域(12～35位氨基酸残基),主要定位在内质网上.该蛋白一些重要的理化特性如分子式、等电点(pⅠ)、相对分子质量、正电荷的氨基酸残基数(Arg+Lys)和负电荷的氨基酸残基数(Asp+Glu)分别为C2645H4099N713O726S15、8.45、57 983、59、56.其二级结构主要由46.41％的α-螺旋、13.15％的延伸链和40.44％的无规则卷曲组成.进一步进化树分析表明,双峰驼CYP2J蛋白与羊和牛的亲缘关系最近.实时荧光定量PCR检测表明,CYP2J基因在所检测的双峰驼各组织均有表达,其中在肝和胰腺的表达量高,其次是肾、肺、心、小肠和血管,而在脾和大肠的表达量较低.因此,本研究成功获得了双峰驼CYP2J基因cDNA的全序列及其开放阅读框(ORF)所编码蛋白的生物学信息,为下一步双峰驼CYP2J蛋白和抗体的制备奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	哈斯苏荣	内蒙古农业大学兽医学院	70	569	12.0	20.0
4	贾志鹏	内蒙古农业大学兽医学院	1	0	0.0	0.0
8	彭小彬	内蒙古农业大学兽医学院	1	0	0.0	0.0
12	罗查干	内蒙古农业大学兽医学院	1	0	0.0	0.0