木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘

• 作者: 丛汉卿 乔飞 孙化鹏 王荣香 龙娅丽
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 木薯 sRNA microRNA 开花 表达特性
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2427-2435
• 页数: 9页
• 分类号: S533
• 字数: 5215字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.12.015

摘要

为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控.本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析.从花序和幼叶测序结果中分别获得12092109条和11499655条sRNA序列.花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979和2603条靶基因.最终筛选出8种与开花调控相关和3种花色调控相关的microRNAs.表达分析显示,miRNAs在两样品间呈现出较大的整体性差异,并且在功能与代谢通路上也不尽相同;开花相关microRNAs中表达差异较大的为miR156、miR172和miR169,其中miR156表达量在花序中高于幼叶,而miR172表达量在花序中低于幼叶,推测其功能为抑制后续的开花过程,避免过度开花.本研究分析了木薯花序与幼叶中sRNA的整体特性,通过表达差异分析初步明确了microRNAs对木薯开花的调控,为进一步深入探索奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龙娅丽	中国热带农业科学院科技信息研究所	5	1	1.0	1.0