细菌单杂交方法在筛选甲基营养菌甲醇脱氢酶启动子结合蛋白中的应用

• 作者: 张梦宁 李俊乐 葛欣 谢录翰 辛琪 邹琪琪 齐姗姗
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 转录因子 文库构建 细菌单杂交系统
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 1705-1714
• 页数: 10页
• 分类号: Q935
• 字数: 5977字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2018.10.14

摘要

为了构建甲基营养菌转录因子亚文库及筛选与甲醇脱氢酶启动子DNA相互作用的蛋白质,对甲基营养菌MP688的基因组和转录组数据进行分析,使用关键词对全基因注释信息和转录组结果进行搜索,找到相关基因的核苷酸序列,通过PCR获得目的片段并构建一系列转录因子亚文库,利用细菌单杂交系统筛选转录因子亚文库找到与甲醇脱氢酶启动子具有相互作用的调控因子.成功构建完成含有32个转录因子的亚文库,建立了甲基营养菌中细菌单杂交筛选方法,通过该方法筛选出2个与甲醇脱氢酶启动子具有强相互作用的转录因子基因.对于基因组已测序的细菌来说,构建转录因子亚文库筛选效率要优于构建基因组文库和cDNA文库,细菌单杂交系统能成功用于甲基营养菌,并能快速高效地筛选与启动子具有相互作用的转录因子.这一方法的建立,为阐明甲醇脱氢酶在甲基菌生长和代谢产物合成中的调控机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛欣	河北大学生命科学学院	10	35	3.0	5.0
2	李俊乐	河北大学生命科学学院	4	1	1.0	1.0
3	邹琪琪	河北大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0
4	齐姗姗	河北大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
5	谢录翰	河北大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0
6	辛琪	河北大学生命科学学院	5	5	2.0	2.0
7	张梦宁	河北大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0