基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜新转录本的鉴定

• 作者: 刘建丰 安素妨 张莹莹 徐文 李保全 王艳 贾琳琳 鲁丹丹
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 转录组测序 新转录本 RNA-seq
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 38-42
• 页数: 5页
• 分类号: S513
• 字数: 2958字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.04.007

摘要

为了鉴定甘蓝型油菜基因组中新的未知转录本,以甘蓝型油菜叶片为材料提取总RNA,构建cDNA文库并使用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序.用生物信息学的方法分析高质量的测序reads来鉴定新的未知转录本.结果表明,在甘蓝型油菜基因组已知基因的间隔区共鉴定到7 720个候选新转录本,通过RT-PCR和克隆测序验证了15个新鉴定的转录本.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李保全		20	49	4.0	5.0
2	安素妨	河南省农业科学院作物设计中心	7	7	2.0	2.0
3	王艳	河南省农业科学院作物设计中心	6	13	2.0	3.0
4	鲁丹丹	河南省农业科学院作物设计中心	6	7	2.0	2.0
5	张莹莹	河南省农业科学院作物设计中心	4	12	2.0	3.0
6	刘建丰	河南省农业科学院农业经济与信息研究所	3	8	2.0	2.0
7	徐文	河南省农业科学院作物设计中心	4	4	1.0	2.0
8	贾琳琳	河南省农业科学院作物设计中心	2	3	1.0	1.0