梨萜类合成酶基因家族生物信息学与表达模式分析

• 作者: 刘恒 刘斌 张元湖 赵荣荣 郭超
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 梨 萜类合成酶 TPS基因家族 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 131-141
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0804

摘要

萜类合成酶(Terpene synthases,TPS)是萜类化合物合成过程中的关键酶.基于梨(Pyrus bretschneideri)全基因组数据库,采用生物信息学和分子生物学方法,对梨TPS基因家族进行鉴定和亚家族分类,研究梨TPS基因的结构及编码蛋白质性质和表达模式.共鉴定获得33个萜类合成酶基因家族成员,聚类为5个亚家族,其中,TPS-a亚家族成员数量最多,包含4-7个外显子;主要定位于细胞质,少数分布在线粒体、叶绿体和内质网等;梨TPS蛋白均为亲水性蛋白,α-螺旋和无规卷曲是其二级结构主要组成元件,β-折叠和延伸链散布其中;TPS-a中保守基序个数相对较多,TPS-e/f相对较少;各亚族内蛋白质在三级结构上高度相似.除PbrTPS24外,其余9个TPS基因在根、茎、幼叶和幼芽中均有表达,并且不同的基因在不同部位高表达,PbrTPS存在组织特异性表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张元湖	山东农业大学生命科学院作物生物学国家重点实验室	35	378	11.0	19.0
2	赵荣荣	山东农业大学生命科学院作物生物学国家重点实验室	2	0	0.0	0.0
3	刘斌	山东农业大学生命科学院作物生物学国家重点实验室	4	98	1.0	4.0
4	郭超	山东农业大学生命科学院作物生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
5	刘恒	山东农业大学生命科学院作物生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0