菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析

• 作者: 付苏宏 张勇群 施静 郝豆豆 雷鸣
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 菊叶香藜 萜类化合物 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 59-66,89
• 页数: 9页
• 分类号: S567.21+9|Q949.745.1
• 字数: 3912字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.07.009

摘要

采用生物信息学的方法分析菊叶香藜3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(DsHMGR)基因所编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、保守结构域、二级结构、三级结构,并进行多条氨基酸序列比对和系统进化树构建.结果表明,DsHMGR基因包含一段1725 bp的开放阅读框,编码574个氨基酸,非极性氨基酸为主要氨基酸,等电点为7.46,为不稳定蛋白质,编码蛋白质中不含有信号肽,在N端具有2个疏水区域,含有2个跨膜结构域,DsHMGR蛋白定位到内质网上,在C端和连接区具有较高保守性,在N端保守性较低,含有HMGR蛋白特有的4个保守活性位点,二级结构主要为 α-螺旋,三级结构预测显示DsHMGR蛋白具有N、L和S 3个催化活性中心结构域.HMGR蛋白进化分析中,菊叶香藜与藜科植物聚为一支,遗传距离较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张勇群	西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室	17	14	2.0	3.0
2	付苏宏	西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室	5	1	1.0	1.0
3	施静	西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室	8	1	1.0	1.0
4	郝豆豆	西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室	10	5	1.0	1.0
5	雷鸣	西藏自治区人民政府驻成都办事处医院分子医学实验室	1	0	0.0	0.0