人肺腺癌细胞超保守区的生物信息学分析

• 作者: 岳红云 王东昌 王丽飞 闫振锋 陈刚
• 来源期刊: 心肺血管病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学分析 差异基因 A549 超保守区
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 心肺血管内科
• 页码范围: 619-622
• 页数: 4页
• 分类号: R56
• 字数: 2741字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5062.2018.07.006

摘要

目的:使用生物信息学的方法,分析肺癌细胞(A549)经慢病毒感染后,过表达超保守区基因与正常肺癌细胞之间的差异基因,并进行基因功能和信号通路分析,为肺癌研究提供差异基因.方法:在公共数据库(GEO)中下载6个肺癌细胞差异基因表达阵列数据进行生物信息学分析,筛选出相关的差异基因.使用DAVID和STRING数据库对差异基因表达进行基因功能、信号通路和蛋白互作用分析.结果:共得到230个差异基因,其中217个表达上调,13个表达下调;GO富集分析显示差异基因主要定位于细胞膜外,参与血管内皮生长因子的调节;KEGG信号通路分析显示差异基因主要表现在化学致癌上;蛋白互作网络显示主要的相关蛋白是CFH、MUC5B、PTGS2、LRRK2.结论:本研究从生物信息学方法对数据进行处理,在基因水平上表明肺癌细胞过表达超保守区后存在差异基因,为基础研究筛选出差异,进而服务于临床.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈刚	河北医科大学第三医院呼吸内科	72	287	9.0	13.0
2	王东昌	河北医科大学第三医院呼吸内科	19	70	5.0	7.0
3	王丽飞	河北医科大学第三医院呼吸内科	6	14	3.0	3.0
4	闫振锋	河北医科大学第三医院呼吸内科	3	0	0.0	0.0
5	岳红云	石家庄市第一医院呼吸内科	3	6	1.0	2.0