东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析

• 作者: 哈卓 张涵 李卓昕 李太元 李成辉 李金凤 解长占 赵冠宇 郭影成 金宁一 鲁会军
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 猪细小病毒7型(PPV7) 基因组测定 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 技术支撑
• 页码范围: 71-74
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65
• 字数: 2481字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2018.11.019

摘要

从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株.根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析.结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4％～95.2％、94.1％～95.1％和93.5％～94.3‰CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6％～91.8％、89.8％～92.0％和89.6％～91.7％.通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型.通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高.该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据.