饲粮中性洗涤纤维水平对山羊瘤胃细菌结构及组成的影响

• 作者: 张雪娇 王立志
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中性洗涤纤维 细菌 高通量测序 发酵参数
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 反刍动物营养
• 页码范围: 1377-1386
• 页数: 10页
• 分类号: S826
• 字数: 6266字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2018.04.020

摘要

本研究旨在利用高通量测序技术研究饲粮中性洗涤纤维(NDF)水平对山羊瘤胃细菌结构及组成的影响.选用6只山羊进行3×3拉丁方试验,依据饲粮NDF水平分为低(35.01%, LN组)、中(40.10%,MN组)和高NDF水平组(45.16%,HN组),每组2只.分3期进行饲养试验,每期试验20 d,其中预试期14 d,正试期6 d.正试期结束后采集山羊瘤胃内容物,提取细菌总DNA后,用细菌通用引物对16S rRNA的V4区进行PCR扩增,扩增产物用Illumina HiSeq 250PE测序平台进行高通量测序,测序结果用QIIME 1.8.0等生物信息学软件进行分析.结果表明:1)HN组的瘤胃液氨态氮(NH3?N)浓度极显著低于LN组和MN组(P<0.01);LN组瘤胃液乙酸/丙酸显著低于HN组(P<0.05),但MN组与其他2组无显著差异(P>0.05).2)各组间Chao1指数和Shannon指数的差异均不显著(P>0.05);LN组observed species指数显著高于其他2组(P<0.05),其他2组间则无显著差异(P>0.05).3)在门水平上,3组间所有细菌的相对丰度差异均不显著(P>0.05);在属水平上,HN组普雷沃氏菌科UCG?001(Prevotellaceae UCG?001)、普雷沃氏菌科 UCG?003(Prevotellaceae UCG?003)和瘤胃球菌科 UCG?014(Ruminococ?caceae UCG?014)的相对丰度显著高于其他2组(P<0.05);HN组瘤胃球菌科NK4A214(Rumi?nococcaceae NK4A214 group)、瘤胃球菌科UCG?005(Ruminococcaceae UCG?005)的相对丰度显著高于LN组(P<0.05);HN组SP3?e08和Lachnoclostridium 10的相对丰度显著低于其他2组(P<0.05);LN组解琥珀酸菌属(Succiniclasticum)相对丰度显著高于其他2组(P<0.05);MN组赖氨酸芽孢杆菌属(Lysinibacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)和叶杆菌属(Phyllobacterium)的相对丰度显著高于其他2组(P<0.05),食物谷菌属(Victivallis)的相对丰度极显著高于其他2组(P<0.01).综合得出,饲粮NDF水平在35.01%~45.16%变化时,显著影响山羊瘤胃液NH3?N浓度和乙酸/丙酸,显著影响瘤胃Prevotellaceae UCG?001、Prevotellaceae UCG?003等多种菌属的相对丰度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王立志	四川农业大学动物营养研究所	41	328	9.0	17.0
2	张雪娇	四川农业大学动物营养研究所	2	20	2.0	2.0