基于高通量测序技术的怀山药与菜山药内生细菌多样性比较

• 作者: 刘元 刘淼 文春南 李文 洪利亚 麻兵继
• 来源期刊: 浙江农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 山药 内生细菌 微生物多样性
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 果树与蔬菜
• 页码范围: 1754-1759
• 页数: 6页
• 分类号: S632.1
• 字数: 4315字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16178/j.issn.0528-9017.20181008

摘要

为分析比较怀山药与菜山药根茎内生细菌谱的差异,采用高通量测序技术分别对怀山药和菜山药根茎中的内生细菌16S rDNA V4区域进行扩增和测序,进而对基因序列进行OTU聚类,在OTU的基础上分别对怀山药和菜山药内生细菌的群落组成进行分析.分别从门、 纲、 目、 科、 属、 种6个水平上分析比较了怀山药和菜山药根茎中的内生细菌的群落组成.怀山药内生细菌分布在拟杆菌门(Bacteroidetes,31.8％)、 厚壁菌门(Firmicutes,24.8％)、 变性菌门(Proteobacteria,18.6％)、 酸杆菌门(Acidobacteria,7.6％)、 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes,6.5％)、 绿菌门(Chlorobi,3.7％)、 绿弯菌门(Chloroflexi,3.4％)、 放线菌门(Actinobacteria,2％)、 黏胶球形菌门(Lentisphaerae,0.6％)、 疣微菌门(Verrucomicrobia,0.6％)、 装甲菌门(Armatimonadetes,0.3％)和浮霉菌门(Planctomycetes,0.3％)12个门;菜山药内生细菌分布在厚壁菌门(Firmicutes,38.3％)、 拟杆菌门(Bacteroidetes,24.5％)、 变性菌门(Proteobacteria,13.2％)、 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes,11％)、 绿菌门(Chlorobi,7.9％)、 酸杆菌门(Acidobacteria,2.5％)、 绿弯菌门(Chloroflexi,1.4％)、 黏胶球形菌门(Lentisphaerae,0.6％)和浮霉菌门(Planctomycetes,0.6％)9个门.从ChaoⅠ、Simpson和Faith's PD等生态指数和Rank-Abundance曲线方面分析了2种山药品种内生细菌群落内的物种丰富度和均度.怀山药内生菌多样性要大于菜山药,且菌落组成比菜山药均匀.怀山药和菜山药根茎中的优势菌属均为狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto 1).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	麻兵继	河南农业大学农学院中药材系	45	291	10.0	15.0
2	文春南	河南农业大学农学院中药材系	11	51	4.0	7.0
3	李文	河南农业大学农学院中药材系	22	161	8.0	12.0
4	洪利亚	河南农业大学农学院中药材系	3	4	1.0	2.0
5	刘淼	河南农业大学农学院中药材系	5	4	1.0	2.0
6	刘元	河南农业大学农学院中药材系	6	8	2.0	2.0