高通量测序分析食用玫瑰花瓣内生细菌多样性

• 作者: 夏体渊 徐胜光 李冰 王定康 郭丽红 陈泽斌 靳松
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 高通量测序 食用玫瑰 花瓣 内生细菌 多样性
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 分析与检测
• 页码范围: 227-235
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2017.09.029

摘要

目的:比较食用玫瑰与观赏玫瑰花瓣内生细菌群落结构差异.方法:应用高通量测序技术测定食用玫瑰(SM)和观赏玫瑰(GM)花瓣内生细菌的16S rDNA-V4变异区序列,应用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和Alpha多样性,以及物种丰富度的差异.结果:本研究获得用于分析的有效序列和OTU数为17 401/27 (SM)、11 143/24 (GM);稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.SM和GM样品的Chao1指数分别为34.0和25.667,Shannon多样性指数分别为1.269和0.649.观赏玫瑰花瓣内生细菌的优势菌属为埃希氏菌属(34.48％)、无色杆菌属(13.79％)、寡养单胞菌属(13.79％);食用玫瑰花瓣内生细菌的优势菌属为Faecalibacterium属(25.53％)、无色杆菌属(17.02％)、瘤胃球菌属(14.89％).地发菌属、冷杆菌属、瘤胃球菌属为食用玫瑰特有,在观赏玫瑰中未检测到.结论:食用玫瑰与观赏玫瑰花瓣内生细菌菌群存在差异,高通量测序技术为植物内生细菌的研究提供准确、科学的数据资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李冰	中国科学院昆明动物研究所	67	409	12.0	16.0
2	王定康	昆明学院农学院	47	216	8.0	12.0
3	陈泽斌	昆明学院农学院	57	191	7.0	10.0
4	徐胜光	昆明学院农学院	19	98	6.0	9.0
5	靳松	昆明学院农学院	29	96	6.0	8.0
6	夏体渊	昆明学院农学院	24	53	4.0	5.0
7	郭丽红		6	27	3.0	5.0