黑果枸杞中调控花青素合成代谢的bHLH基因克隆与序列分析

• 作者: 刘宝龙 宗渊 朱雪冰 李建民 赵鑫 郑旭莹
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 黑果枸杞 bHLH 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（20）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 6616-6623
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.006616

摘要

以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA中克隆一个bHLH的转录因子——LrJAF13,通过生物信息学的分析,发现该基因的全长为1 890 bp,编码624个氨基酸的亲水蛋白,其分子式是C3012H443N853O978S24,分子量为6.94 kD,脂肪指数(Aliphatic index)为85.45,等电点pI为5.24,亲水性(Grand average of hydropathicity)为-0.497,不稳定指数(Instability index)为50.13,推断出该基因编码的蛋白位于细胞核中,蛋白质三维结构复杂,包含多个α-螺旋和β-折叠结构,与矮牵牛拟南芥bHLH基因编码的蛋白序列的一致性为88％,进化树的分析表明黑果枸杞的LrJA F13与矮牵牛的bHLH的转录因子petunia_JAF13的亲缘关系比较接近.通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青素含量的分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据.