ORF1编码的四种非结构蛋白可用于戊型肝炎病毒的基因分型

• 作者: 王跃荣 胡玲玲 郑海音
• 来源期刊: 智慧健康
• 关键词: 戊型肝炎病毒 基因型 开放阅读框1 进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（19）
• 所属期刊栏目: 生物医学工程
• 页码范围: 16-18
• 页数: 3页
• 字数: 2529字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19335/j.cnki.2096-1219.2018.19.008

摘要

目的 探讨人类戊型肝炎病毒(HEV)开放阅读框(ORF)1编码的四种非结构蛋白的基因序列能否用于其基因组的分型.方法 从GenBank中查找并下载能感染人类测序完整的全基因组的HEV基因组及蛋白序列共35株,用Clustal W程序对35株HEV的ORF1编码区序列进行多序列比对,并用treev32绘制基因进化树,研究其进化关系.结果 HEV的基因组全长为7.5kb;而RNA依赖的RNA聚合酶只有1460bp,其他的基因序列则更短,木瓜样半胱氨酸蛋白酶为479bp、解旋酶为734bp,多聚脯氨酸铰链只有200bp.这四种蛋白的多序列比对和进化分析结果与GenBank中的分型结果相符.结论 HEV ORF1编码表达的木瓜样半胱氨酸蛋白酶、多聚脯氨酸铰链、解旋酶和RNA依赖的RNA聚合酶的基因序列更短,且可作为HEV的分型依据,从而为HEV的分型找到了一种更简便、快捷的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王跃荣	上海中医药大学附属市中医医院检验科	11	59	4.0	7.0
2	胡玲玲	上海中医药大学附属市中医医院检验科	5	2	1.0	1.0
3	郑海音	上海中医药大学附属市中医医院检验科	3	0	0.0	0.0