木本油料文冠果APETALA2基因全长cDNA序列与生物信息学分析

• 作者: 刘晓辉 李志民 王莉 罗媛 马静怡
• 来源期刊: 现代农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 文冠果 APETALA2基因 cDNA 亲水性 α螺旋 同源性
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 145-146
• 页数: 2页
• 分类号: S794.9
• 字数: 2187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5739.2018.02.083

摘要

文冠果是我国北方特有的木本油料树种.AP2是植物种子发育调控的重要转录因子.根据已获得的文冠果转录组数据搜索文冠果AP2基因序列(XsAP2),并对XsAP2基因全长cDNA序列进行生物信息学分析.结果表明,XsAP2基因cDNA序列包含1个长度为1548 bp的完整ORF,编码515个氨基酸.XsAP2蛋白大部分区域为亲水区,由136个α螺旋、89个延伸链、43个β-转角、247个无规则卷曲构成.依据2gcc.1.A同源建模法,获得1个三级结构模型,该模型从第153个氨基酸开始到第213个氨基酸结束.XsAP2蛋白与9种其他植物AP2蛋白的同源性分析显示,文冠果AP2与可可AP2的同源性最高(71％).该结果可为解析文冠果种子生长发育的分子调控机制提供理论依据,并有助于文冠果油品质改良和文冠果分子育种工作.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王莉	大连民族大学环境与资源学院	43	120	7.0	9.0
2	刘晓辉	大连民族大学环境与资源学院	5	1	1.0	1.0
3	马静怡	大连民族大学环境与资源学院	2	1	1.0	1.0
4	罗媛	大连民族大学环境与资源学院	2	1	1.0	1.0
5	李志民	大连民族大学环境与资源学院	2	1	1.0	1.0