文冠果MAPK16基因全长cDNA序列与生物信息学分析

• 作者: 徐世琦 文嗣鑫 王兵 王莉 纪冬颖 邓金兰
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 文冠果 MAPK16蛋白 亲水性 ɑ螺旋 同源性
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 12-16
• 页数: 5页
• 分类号: F307.11|S341.1
• 字数: 2662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2020.02.004

摘要

为探明文冠果MAPK16基因的生物学特征及功能,根据文冠果de novo转录组数据搜索MAPK16基因的cDNA序列(XsMAPK16),并对XsMAPK16基因全长cDNA序列进行生物信息学分析.结果显示,XsMAPK16基因cDNA序列包含1个长度为1677bp的完整ORF,可编码558个氨基酸.XsMAPK16蛋白大部分区域为亲水区,由235个ɑ螺旋、232个无规则卷曲,59个延伸链、32个β转角构成.依据2gcc.1.A同源建模法,获得1个三级结构模型,该模型从第12个氨基酸开始到第362个氨基酸结束.XsMAPK16蛋白与12种其他植物MAPK蛋白的同源性分析显示,文冠果MAPK16与甜橙MAPK的同源性最高(94.93％).该结果将为解析文冠果抗旱的调控机制提供新的理论基础,并为文冠果的抗旱育种提供新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王莉	大连民族大学环境与资源学院	43	120	7.0	9.0
2	文嗣鑫	大连民族大学环境与资源学院	1	0	0.0	0.0
3	邓金兰	大连民族大学环境与资源学院	2	0	0.0	0.0
4	纪冬颖	大连民族大学环境与资源学院	1	0	0.0	0.0
5	王兵	大连民族大学环境与资源学院	1	0	0.0	0.0
6	徐世琦	大连民族大学环境与资源学院	2	0	0.0	0.0