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腾冲红花油茶蜜腺2个发育时期转录组差异性分析
腾冲红花油茶蜜腺2个发育时期转录组差异性分析
作者:
任晓晓
卿卓
和绍禹
李林庶
苏睿
董坤
赵文正
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
腾冲红花油茶
蜜腺
转录组
Illumina测序
摘要:
[目的]植物蜜腺基因能够调控其分泌产物花蜜中的化学组成,从而影响植物对传粉者的吸引力,本研究主要揭示腾冲红花油茶蜜腺发育与分泌过程中其基因表达的变化情况.[方法]采用高通量Illumina Hiseq测序手段对花蕾期蜜腺与泌蜜高峰期蜜腺进行转录组测序,并对测序数据进行相关分析研究,探讨蜜腺发育与分泌过程中的调控基因.[结果]在蜜腺发育与分泌过程中共检测到58 488个差异基因,其中表达上调的基因有1 602个,表达下调的基因有693个.GO分析结果表明:被注释生物学过程的差异表达基因有3 096个,其中富集差异基因数量较多的生物学过程为胞内过程、生物调节过程和新陈代谢过程;富集于分子功能的差异表达基因有1 280个,其中富集差异基因数量较多的分子功能为连接功能、催化活性和载体活性.Pathway显著性富集分析发现:有2 147个差异表达基因参与了292条代谢途径,其中富集差异基因数量最多的途径是代谢途径(941个,占43.83%),主要是参与糖代谢、氨基酸代谢等过程.[结论]蜜腺发育及花蜜分泌过程中大多数差异表达基因与花蜜化学组成的调控过程有关.
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文献信息
篇名
腾冲红花油茶蜜腺2个发育时期转录组差异性分析
来源期刊
云南农业大学学报(自然科学)
学科
生物学
关键词
腾冲红花油茶
蜜腺
转录组
Illumina测序
年,卷(期)
2019,(2)
所属期刊栏目
作物遗传 & 育种·生物安全
研究方向
页码范围
185-192
页数
8页
分类号
Q756
字数
5900字
语种
中文
DOI
10.12101/j.issn.1004-390X(n).201803045
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
和绍禹
云南农业大学动物科学技术学院
121
700
13.0
21.0
2
董坤
云南农业大学动物科学技术学院
81
873
16.0
27.0
3
赵文正
云南农业大学动物科学技术学院
20
30
4.0
4.0
4
任晓晓
云南农业大学动物科学技术学院
4
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2.0
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卿卓
云南农业大学动物科学技术学院
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被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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节点文献
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蜜腺
转录组
Illumina测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
云南农业大学学报(自然科学)
主办单位:
云南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-390X
CN:
53-1044/S
开本:
大16开
出版地:
昆明黑龙潭云南农业大学
邮发代号:
64-16
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
3500
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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