北京市东城区2017-2018监测年度H<em>3</em>N<em>2</em>亚型流感病毒HA1基因进化分析

• 作者: 李姗姗 李艳宇 高鹏
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 流感病毒 H3N2亚型 HA1基因 进化树 疫苗株
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 144-148
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2018.0082

摘要

目的 了解北京市东城区2017-2018监测年度H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因序列变异特征及进化情况.方法 对北京市东城区2017年4月1日至2018年3月30日采集的流感样病例咽拭子进行核酸检测及病毒分离, 将分离得到的12株H3N2亚型流感病毒进行HA1基因序列测定, 通过DNAStar 5.0和MEGA 6.0软件与国际卫生组织 (WHO) 推荐的北半球2017-2018年流感疫苗株、2018-2019年流感疫苗株进行比对, 绘制系统进化树.结果 以2017-2018年流感疫苗株[A/HongKong/4801/2014 (H3N2) -like virus]为参比序列, 12株分离株中共发现HA1基因序列中20个氨基酸位点发生改变;涉及到2个抗原决定簇、受体结合位点 (RBS) 及附近位置.而2018-2019年推荐的疫苗株[A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016 (H3N2) -like]氨基酸一些变异位点与12株分离株的氨基酸变异位点一致, 差异较小.12株H3N2亚型流感病毒的HA1基因核苷酸同源性为96.35％～100.00％, 氨基酸的同源性为94.97％～100.00％, 与WHO推荐的2018-2019年疫苗株同源性更高;系统进化树显示, 分离到的流感毒株大部分与2018-2019年推荐的疫苗株在一个大分支上, 亲缘关系较近, 与2017-2018年疫苗株距离较远, 差异较大.结论2017-2018监测年度北京市东城区H3N2亚型流感病毒的HA1基因特性发生了一定改变, 与WHO推荐的2018-2019年新疫苗株匹配性更好, 将为北京市流感监控发挥更好的保护作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高鹏	北京市东城区疾病预防控制中心微生物检验科	7	13	3.0	3.0
2	李艳宇	北京市东城区疾病预防控制中心微生物检验科	6	8	2.0	2.0
3	李姗姗	北京市东城区疾病预防控制中心微生物检验科	4	8	2.0	2.0