斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析

• 作者: 冯陈晨 呼和巴特尔 孙柯 王姝懿 王文龙 赵学亮
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 原核表达载体 SHR基因 抗原表位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 页码范围: 116-123
• 页数: 8页
• 分类号: S855.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2019.06.13

摘要

为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析.结果 表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,a-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60％;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白.推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王文龙		30	108	6.0	9.0
2	王姝懿		2	0	0.0	0.0