三穗鸭IP3R3基因的表达、遗传变异及对蛋壳品质效应的影响

• 作者: 吴磊 平立锋 张依裕 李杰章 熊建民 覃媛钰 谭光辉
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三穗鸭 三磷酸肌醇受体Ⅲ型(IP3R3) 基因多态 蛋壳品质
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 2033-2041
• 页数: 9页
• 分类号: S834.89
• 字数: 5355字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.11.014

摘要

三磷酸肌醇受体Ⅲ型(inositol triphosphate receptor typeⅢ,IP3R3)是介导细胞内钙离子释放的第二信使,能结合三磷酸肌醇(IP3)形成钙离子通道,调节细胞内钙离子的释放.为了探究IP3R3基因对鸭(Anas platyrhyncha domestica)蛋壳品质的遗传效应,以期丰富蛋鸭相关重要经济性状的分子遗传研究基础.本研究以贵州三穗鸭为研究对象,采用qRT-PCR检测鸭IP3R3基因的组织表达;根据Genbank中IP3R3基因的序列,设计PCR扩增引物,直接回收、纯化、测序,利用DNAStar软件MegAlign程序结合测序峰图筛查鉴定120只三穗鸭的SNP位点,并运用SPSS18.0一般线性模型(general linear model,GLM)分析SNPs对蛋壳品质的相关性.实验结果显示,在鸭11个组织中均检测到IP3R3基因的表达,其中蛋壳腺表达丰度最高,肺、胸肌、肌胃相对表达量最低,其相对表达量顺序为蛋壳腺>心脏>脾>腺胃>胰腺>肾>肝>小肠>肺>胸肌>肌胃.SNPs鉴定结果表明,在IP3R3基因中发现4个SNP位点,分别是位于外显子20的g.21663 C>T和g.21699 G>A,以及位于内含子19的g.21646 G>C和内含子20的g.21825 C>A;进一步分析发现,第20外显子g.21663 C>T、g.21699 G>A是同义突变位点,未引起酪氨酸(TAC)和赖氨酸(AAG)的改变.遗传特性分析结果显示,4个SNP位点均为中度多态位点,且均偏离哈德-温伯格平衡(P<0.05);关联分析结果显示,g.21646位点对蛋形指数的影响达到显著水平(P<0.05),其中GG基因型蛋形指数显著高于CC基因型;g.21663位点对蛋壳强度的影响达到显著水平(P<0.05),其中CT基因型蛋壳强度显著高于TT和CC基因型(P<0.05),另外2个SNP位点对蛋壳品质的影响未达到显著水平.综合关联分析和表达量结果,IP3R3基因在鸭蛋壳腺中表达量均高于其他组织,初步推测IP3R3在蛋壳腺中高度表达可能与蛋壳品质调控有关;g.21663和g.21646位点均对鸭蛋壳品质影响显著(P<0.05),可以作为鸭蛋壳品质性状分子标记辅助的候选标记,该结果为提高鸭蛋品质及家禽选育工作提供科学资料.