高通量测序筛查特发性牙龈纤维瘤和正常牙龈外泌体miRNAs差异表达

• 作者: 冉丽权 张明珠 殷顺会 詹烨明 贾凤梅
• 来源期刊: 昆明医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 特发性牙龈纤维瘤病 牙龈成纤维细胞 外泌体 外泌体miRNA 高通量测序
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 23-30
• 页数: 8页
• 分类号: R781.4
• 字数: 5456字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-4706.2019.04.006

摘要

目的 利用高通量测序技术筛选出特发性牙龈纤维瘤病牙龈成纤维细胞(IGF-GFs)与正常个体牙龈成纤维细胞(N-GFs)分泌的外泌体中差异表达的miRNAs,通过生物信息学分析预测靶基因和相关信号通路,进而为研究特发性牙龈纤维瘤病的发病机制奠定基础.方法 原代培养IGF-GFs和N-GFs,收集细胞培养上清提取外泌体;使用IlluminaHiSeqTM 2500测序平台对IGF-GFs和N-GFs来源外泌体中的miRNAs进行测序分析,使用TargetScan、miRDB、miRTarBase、miRWalk四款软件、KEGG数据库对部分表达差异显著的miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路预测,并使用实时荧光定量PCR技术验证外泌体中差异性miRNAs的表达.结果 IGF-GFs和N-GFs来源的外泌体中miRNA分别占ncRNA中的0.74％、0.46％;高通量测序筛选出92个显著差异表达的miRNAs,挑选的12个miRNAs共预测出靶基因1304个以及多条信号通路,实时荧光定量PCR技术检测的3个miRNAs在IGF-GFs和N-GFs来源的外泌体中均有差异表达,且差异有统计学意义(P<0.05).结论 来源于IGF-GFs和N-GFs外泌体miRNAs存在着差异性表达,且测序结果可靠.差异表达的miRNAs在IGF发病中可能起重要调控作用,且这些miRNAs可能通过靶向相关靶基因的3'UTR或经由相关信号通路介导IGF的发生发展过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张明珠	昆明医科大学口腔医学院牙周科	25	62	5.0	6.0
2	詹烨明	昆明医科大学口腔医学院牙周科	2	3	1.0	1.0
3	贾凤梅	昆明医科大学口腔医学院牙周科	2	1	1.0	1.0
4	殷顺会	昆明医科大学口腔医学院牙周科	2	1	1.0	1.0
5	冉丽权	昆明医科大学口腔医学院牙周科	3	1	1.0	1.0