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高通量测序应用于PCOS患者卵泡液外泌体lncRNA表达谱分析
高通量测序应用于PCOS患者卵泡液外泌体lncRNA表达谱分析
作者:
刘琳
吕芳
张晓梅
王丽萍
王欣
王静怡
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
多囊卵巢综合征
外泌体
长链非编码RNA
基因测序
摘要:
目的 研究多囊卵巢综合征(PCOS)患者卵泡液外泌体内差异 lncRNA的表达,探究差异表达 lncRNA的分子功能及代谢途径和信号通路. 方法 收集2018年1~12月于苏北人民医院生殖中心就诊的56例不孕患者卵泡液并记录相关临床资料.其中 PCOS导致的不孕患者为 PCOS组(n=28),输卵管不通导致的非 PCOS 不孕患者为对照组(n=28).利用超高速离心法分离卵泡液外泌体,透射电子显微镜(TEM)观察其大小和形态,纳米颗粒跟踪分析(NTA)以及Western Blot鉴定分离获得的外泌体,提取外泌体总 RNA.随机选取两组各3份卵泡液外泌体 RNA 进行 lncRNA 高通量测序,鉴定差异 lncRNA并进行 GO富集和 KEGG通路等生物信息学分析,选取6个差异基因通过 RT-qPCR 验证测序结果. 结果 两组患者的年龄、总孕酮、雌激素(E2)、FSH、获卵数、可移植胚胎数等均无显著差异(P>0.05);体重指数(BMI)、LH 和窦卵泡数均存在显著差异(P<0.05).外泌体 RNA测序结果显示,PCOS患者外泌体共检测到1866个差异表达 lncRNA基因,其中1253个基因表达上调,613个基因表达下调.GO 富集和 KEGG通路分析表明,差异 lncRNA 主要富集于组织细胞成分或生物发生等生物学过程,以及卵母细胞减数分裂和胰岛素抵抗等信号通路.RT-qPCR验证差异lncRNA基因的表达结果与测序一致. 结论 PCOS患者外泌体中 lncRNA存在差异表达,提示 lncRNA在 PCOS的发病中发挥一定作用.
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篇名
高通量测序应用于PCOS患者卵泡液外泌体lncRNA表达谱分析
来源期刊
生殖医学杂志
学科
医学
关键词
多囊卵巢综合征
外泌体
长链非编码RNA
基因测序
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
620-627
页数
8页
分类号
R711.6
字数
3951字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1004-3845.2020.05.011
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基因测序
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期刊影响力
生殖医学杂志
主办单位:
北京协和医院
国家人口计生委科学技术研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-3845
CN:
11-4645/R
开本:
大16开
出版地:
北京市帅府园1号
邮发代号:
80-419
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
9
总被引数(次)
22615
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