乳头状肾细胞癌差异表达基因和通路生物信息学分析

• 作者: 崔嘉晗 牛海涛 王新生 赵明
• 来源期刊: 青岛大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 癌,肾细胞 基因本体 信号通路 遗传关联研究 计算生物学
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 402-405,410
• 页数: 5页
• 分类号: R730.26
• 语种: 中文
• DOI: 10.11712/jms201904006

摘要

目的 探讨生物信息学分析对乳头状肾细胞癌(PRCC)差异表达基因和通路的意义.方法 分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中PRCC的RNA测序数据,应用生物信息学分析筛选差异表达基因,并对候选基因依据功能和信号通路进行富集分析.结果 分析TCGA中PRCC和癌旁正常组织的RNA测序数据,筛选4 639个差异表达的基因.对筛选差异表达基因进行基因本体及代谢通路富集分析后得到818个基因本体术语(GOterms)和110条信号通路术语(pathway terms).结论 运用edgeR包以及基因本体及信号通路分析,筛选了PRCC与癌旁正常组织差异表达基因及富集的信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛海涛	青岛大学附属医院	51	121	5.0	10.0
2	赵明	青岛大学附属医院	7	17	2.0	4.0
3	王新生	青岛大学附属医院	63	235	8.0	12.0
4	崔嘉晗	青岛大学附属医院	2	0	0.0	0.0