基于DNA条形码psbA-trnH,matK,trnL对不同地理居群野菊和药用菊的鉴定研究

• 作者: 张亚静 朱再标 杨锋 汪涛 邹庆军 郭巧生 陈芙蓉
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 关键词: 野菊 药用菊 DNA条形码 SNPs 鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 野菊资源品质评价及其野生抚育研究专题
• 页码范围: 660-665
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

利用DNA条形码技术通过psbA-trnH, mat K, trn L序列分析, 建立一种快速鉴定野菊和药用菊的方法.提取21份样品的基因组DNA, 对psbA-trnH, mat K, trn L片段进行PCR扩增, 双向测序, 获得其psbA-trnH, mat K, trn L序列信息;运用MEGA 7. 0对所有样品的psbA-trnH, mat K, trn L序列共63条进行比对、计算种内种间遗传距离, 分析psbA-trnH+mat K+trn L组合序列SNPs分布, 构建Neighbor-Joining (NJ) 系统进化树.结果显示, 野菊, 野菊 (菊花脑) 和药用菊的种内种间遗传距离重合; psbA-trnH+mat K+trn L组合序列的SNPs分析显示其组合序列共有19个核苷酸多态性位点 (SNPs) , 野菊较野菊 (菊花脑) 、药用菊呈现更为明显的序列多态性, psbA-trnH序列表现出较为明显的长度变异; NJ树显示药用菊与野菊、野菊 (菊花脑) 区别开来, 其中编号为C2～C5的药用菊单独聚为一亚支, 置信度为62％, 编号为Z9, Z10的野菊均采自甘肃省, 单独聚为一支, 置信度为77％;同时也发现来自西北地域的野菊样品, 其psbA-trnH和trn L序列信息变化与地域和环境之间有明显的相关, 野菊与野菊 (菊花脑) 具有明显的分化, 同时还是药用菊的进化来源.因此, 将psbA-trnH+mat K+trn L组合序列作为DNA条形码能准确、快速的鉴别野菊和药用菊, 为其种质资源鉴定及物种鉴别提供了重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭巧生	南京农业大学中药材研究所	284	4374	34.0	46.0
2	邹庆军	南京农业大学中药材研究所	9	21	2.0	4.0
3	汪涛	南京农业大学中药材研究所	34	434	12.0	20.0
4	陈芙蓉	南京农业大学中药材研究所	3	4	2.0	2.0
5	朱再标	南京农业大学中药材研究所	31	184	9.0	11.0
6	杨锋	南京农业大学中药材研究所	2	2	1.0	1.0
7	张亚静	南京农业大学中药材研究所	4	17	2.0	4.0