悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选

• 作者: 巫伟峰 张群英 李永霞 杨鼎元 沈玺龙 王瑶 陈哲
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 悬钩子属 DNA条形码筛选 物种鉴定 matK trnH-psbA
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 301-307
• 页数: 7页
• 分类号: S663.2
• 字数: 3625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.02.018

摘要

为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列.该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析.结果 显示,trnH-psbA、matK、rbcL、rtnL-trnF的种内变异与种间变异差异较大,变异分辨率分别为97.32％、83.33％、79.07％、64.95％,存在较大的barcoding gap;NJ一致树分析显示,matK的单系性比例最高(67％),其次为trnH-psbA (64％),rtnL-trnF (43％),rbcL(30％).结果 表明,悬钩子属植物的matK与trnH-psbA序列种内变异与种间变异差异较大,能较好地区分不同物种,具有较大的鉴定潜力.建议将matK和trnH-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列,rtnL-trnF、rbcL作为辅助条形码序列.