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结直肠腺瘤的加权基因共表达网络构建与分析
结直肠腺瘤的加权基因共表达网络构建与分析
作者:
刘海峰
屈亚威
高亚东
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结直肠腺瘤
加权基因共表达网络分析
上皮内瘤变
模块
摘要:
目的 利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法探究结直肠腺瘤(colorectal adenoma,CRA)潜在的分子机制.方法 采用WGCNA构建CRA的基因共表达网络并识别共表达模块,通过功能富集分析了解这些模块中基因的生物学功能,并筛选出与样本上皮内瘤变级别密切相关的枢纽基因.结果 本文鉴别出15个共表达模块.这些模块中基因分别在乏氧应答、骨形态生成蛋白信号通路负性调节、脂质代谢等过程显著富集.此外本研究获得8个与上皮内瘤变级别相关的模块,并在相关性最高的模块中识别出了11个枢纽基因.结论 通过WGCNA识别出一些与结直肠腺瘤相关的模块(其中淡绿色模块相关性最高)和枢纽基因(包括ACBD7、GAGE7、ZNF713、HPX-2、WIPF3、GBP6、GNG13、PAX4、REXO1L1、POTEG、JAKMIP3),这些模块及基因为进一步了解结直肠腺瘤的发生发展机制提供了新的线索.
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文献信息
篇名
结直肠腺瘤的加权基因共表达网络构建与分析
来源期刊
中华灾害救援医学
学科
医学
关键词
结直肠腺瘤
加权基因共表达网络分析
上皮内瘤变
模块
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
31-36
页数
6页
分类号
R735
字数
4663字
语种
中文
DOI
10.13919/j.issn.2095-6274.2019.01.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
高亚东
解放军总医院第三医学中心消化内科
2
0
0.0
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2
屈亚威
解放军总医院第三医学中心消化内科
8
1
1.0
1.0
3
刘海峰
解放军总医院第三医学中心消化内科
8
1
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1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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2019(0)
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二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
结直肠腺瘤
加权基因共表达网络分析
上皮内瘤变
模块
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华灾害救援医学
主办单位:
中国人民武装警察部队总医院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-6274
CN:
10-1158/R
开本:
16开
出版地:
北京海淀区永定路69号
邮发代号:
创刊时间:
2013
语种:
chi
出版文献量(篇)
1843
总下载数(次)
2
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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