普通烟草Aux/IAA转录因子家族全基因组鉴定分析

• 作者: 周东洁 牛永志 王国平 郑昀晔
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 关键词: 烟草 Aux/IAA 生物信息 基因家族
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 80-89
• 页数: 10页
• 字数: 6743字
• 语种: 中文

摘要

Aux/IAA是一种生长素早期响应因子,影响生长素对植物生长发育的调控.烟草作为一种模式植物,在烟草中鉴定Aux/IAA家族基因对于研究生长素调控机制具有重要意义.本研究利用生物信息学方法,从普通烟草基因组中鉴定出77个Aux/IAA家族基因,平均氨基酸数为379,全部为亲水性蛋白,大部分为酸性蛋白.其中46个基因定位到19条连锁群上,分布最多的22号连锁群上有6个基因,其余31个基因位于Scafford上,所有基因均定位于细胞核内.Aux/IAA家族划分为2个类群,10个亚群,包括6对直系同源和40对旁系同源姐妹对,每个亚群中都分布有烟草的Aux/IAA基因.所有的烟草Aux/IAA基因均缺失了结构域Ⅰ,68个基因同时包含Aux/IAA结构域Ⅲ和Ⅳ,21个B6亚组基因包含B3、ARF和Aux/IAA结构域.内含子-外显子结构除了B6亚组基因外,都较为简单.表达模式分析结果显示,不同亚群的基因组织表达特异性不同,同一亚群的基因组织表达特异性一致.Aux/IAA家族基因主要参与细胞组成、蛋白结合、生物进程调节、信号转导、刺激反应、代谢过程等功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑昀晔		59	451	10.0	17.0
3	牛永志		31	240	8.0	14.0
6	王国平		5	7	1.0	2.0
7	周东洁		5	7	1.0	2.0