青杄PwPEBP基因及其启动子序列的克隆与表达分析

• 作者: 孙永江 张凌云 张孟娟 李兴芬 苗雅慧
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 青杄 PEBP 启动子 基因表达 胁迫响应
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 8-20
• 页数: 13页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20180344

摘要

[目的]通过研究青杄中的PwPEBP基因及其启动子的表达特性及生物学功能,探究PEBP基因在植物生长发育过程中响应逆境胁迫的功能及作用机制.[方法]本研究从青杄转录组测序中获得PwPEBP的cDNA序列,利用TMHMM、GOR4等在线软件对PwPEBP蛋白进行生物信息学分析,以此为基础通过PCR技术克隆得到PwPEBP开放阅读框(ORF)序列;同时对其在不同组织与不同逆境及激素处理中的表达水平进行了RT-qPCR技术分析;采用染色体步移法克隆PwPEBP的启动子序列,并利用在线软件BDGP和PlantCARE对PwPEBP启动子序列进行基础启动子区域、转录起始位点和顺式作用元件的预测;最后通过农杆菌瞬时转化烟草法验证PwPEBP启动子的功能.[结果]PwPEBP cDNA长度为1408 bp,开放阅读框共585 bp,编码194个氨基酸.PwPEBP蛋白分子式为C966H1484N250O299S6,无信号肽和跨膜结构域,为亲水蛋白,含有25个磷酸化位点;进化树分析显示,PwPEBP蛋白与北美云杉的PEBP单独聚成一簇,属于新的PEBP蛋白.组织特异性分析显示,PwPEBP在成熟叶中表达量最高,嫩叶中表达量最低;PwPEBP在各激素及逆境诱导下均有表达,但对盐处理无响应.克隆的PwPEBP启动子序列长度为903 bp,其具有响应GA、ABA、SA、MeJA的顺式作用元件.GUS染色及Luc定量实验显示,PwPEBP启动子均能响应GA、ABA、MeJA和SA外源激素及干旱、高温、低温等逆境胁迫.[结论]青杄中PwPEBP基因广泛响应干旱、低温、高温等非生物胁迫,其中对干旱胁迫最为敏感,同时还参与了ABA、GA、MeJA和SA激素的信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张凌云	北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室	39	174	8.0	12.0
2	孙永江	北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室	4	1	1.0	1.0
3	李兴芬	北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	苗雅慧	北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室	2	0	0.0	0.0
5	张孟娟	北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0