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常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析
常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析
作者:
崔云甫
方天逸
林轩
王宇夫
王志东
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
食管肿瘤/病理学
结肠肿瘤/病理学
胰腺肿瘤/病理学
抗原,CD
寡核苷酸序列分析
基因表达
存活率
预后
摘要:
目的 探讨嗜中性粒细胞抗原CD177在常见消化系统恶性肿瘤(食管癌、结肠癌和胰腺癌)中的表达情况与患者预后的关系,并分析与其相关的基因和细胞通路.方法 自公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)及The Cancer Genome Atlas(TCGA)中提取相应癌症数据集,以获取患者信息及mRNA表达数据,借助R2生物信息分析平台,以Kaplan-Meier法绘制生存曲线,分析CD177表达情况与患者预后的关系,筛选出与CD177表达显著相关的基因并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)通路分析.结果 在3种癌症数据集中(食管癌75例,结肠癌174例,胰腺癌132例),CD177的mRNA高表达患者的总体生存率均低于低表达患者(P=0.050,P=0.045,P=0.018).此外,与CD177表达相关的基因在3个数据集中分别有11 927、4 100和7 493个.KEGG通路分析发现,CD177高表达时除正常消化功能的信号通路被激活外,还涉及多种炎性反应机制相关的信号通路.结论 CD177的表达水平与食管癌、结肠癌和胰腺癌患者的总体生存率相关,可能成为研究患者预后的潜在分子标志物.
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文献信息
篇名
常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析
来源期刊
实用肿瘤杂志
学科
医学
关键词
食管肿瘤/病理学
结肠肿瘤/病理学
胰腺肿瘤/病理学
抗原,CD
寡核苷酸序列分析
基因表达
存活率
预后
年,卷(期)
2019,(2)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
111-117
页数
7页
分类号
R735.1|R730.23
字数
语种
中文
DOI
10.13267/j.cnki.syzlzz.2019.02.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
崔云甫
哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科
101
345
10.0
13.0
2
王志东
哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科
38
112
6.0
8.0
3
方天逸
哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科
4
1
1.0
1.0
7
王宇夫
哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科
3
1
1.0
1.0
8
林轩
哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科
5
6
1.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
(36)
共引文献
(2)
参考文献
(15)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
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参考文献(0)
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结肠肿瘤/病理学
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抗原,CD
寡核苷酸序列分析
基因表达
存活率
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用肿瘤杂志
主办单位:
浙江大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-1692
CN:
33-1074/R
开本:
大16开
出版地:
杭州市解放路88号
邮发代号:
32-87
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
3674
总下载数(次)
7
总被引数(次)
21252
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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