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摘要:
目的 探讨嗜中性粒细胞抗原CD177在常见消化系统恶性肿瘤(食管癌、结肠癌和胰腺癌)中的表达情况与患者预后的关系,并分析与其相关的基因和细胞通路.方法 自公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)及The Cancer Genome Atlas(TCGA)中提取相应癌症数据集,以获取患者信息及mRNA表达数据,借助R2生物信息分析平台,以Kaplan-Meier法绘制生存曲线,分析CD177表达情况与患者预后的关系,筛选出与CD177表达显著相关的基因并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)通路分析.结果 在3种癌症数据集中(食管癌75例,结肠癌174例,胰腺癌132例),CD177的mRNA高表达患者的总体生存率均低于低表达患者(P=0.050,P=0.045,P=0.018).此外,与CD177表达相关的基因在3个数据集中分别有11 927、4 100和7 493个.KEGG通路分析发现,CD177高表达时除正常消化功能的信号通路被激活外,还涉及多种炎性反应机制相关的信号通路.结论 CD177的表达水平与食管癌、结肠癌和胰腺癌患者的总体生存率相关,可能成为研究患者预后的潜在分子标志物.
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文献信息
篇名 常见消化系统肿瘤CD177及相关基因表达与意义的生物信息学分析
来源期刊 实用肿瘤杂志 学科 医学
关键词 食管肿瘤/病理学 结肠肿瘤/病理学 胰腺肿瘤/病理学 抗原,CD 寡核苷酸序列分析 基因表达 存活率 预后
年,卷(期) 2019,(2) 所属期刊栏目 临床研究
研究方向 页码范围 111-117
页数 7页 分类号 R735.1|R730.23
字数 语种 中文
DOI 10.13267/j.cnki.syzlzz.2019.02.003
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 崔云甫 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 101 345 10.0 13.0
2 王志东 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 38 112 6.0 8.0
3 方天逸 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 4 1 1.0 1.0
7 王宇夫 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 3 1 1.0 1.0
8 林轩 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 5 6 1.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
食管肿瘤/病理学
结肠肿瘤/病理学
胰腺肿瘤/病理学
抗原,CD
寡核苷酸序列分析
基因表达
存活率
预后
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用肿瘤杂志
双月刊
1001-1692
33-1074/R
大16开
杭州市解放路88号
32-87
1986
chi
出版文献量(篇)
3674
总下载数(次)
7
总被引数(次)
21252
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导