食管鳞癌和腺癌转录组差异基因综合分析

• 作者: 任凯凯 孙金旗 张亚丽 李南 李雨濛 王健 马佳康 马军
• 来源期刊: 医学研究生学报
• 学科: 医学
• 关键词: 食管鳞癌 食管腺癌 转录组 分子特征 ceRNA网络 生存分析
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 715-719
• 页数: 5页
• 分类号: R735.1
• 字数: 2898字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16571/j.cnki.1008-8199.2019.07.009

摘要

目的 食管鳞癌和腺癌在分组特征方面有多大的差异目前并不明确.文中旨在分析食管鳞癌、食管腺癌转录组分子特征的差异性.方法 下载TCGA数据库中食管鳞癌和腺癌转录组数据,筛选癌及癌旁组织差异表达的RNA(mRNA、lncRNA、miRNA),构建食管鳞癌和腺癌相关的竞争性内源RNA(ceRNA)网络,对重要miRNA进行靶基因预测及GO、KEGG分析,利用生存分析显示食管鳞癌和腺癌共有差异基因.结果 ceRNA网络显示:PVT1、LINC00524、miR-204、miR-383、HOXC8、NTRK2等在食管鳞癌和腺癌中均起重要调控作用.miR-204-5p经miRWalk共预测到13227个调控靶基因,在targetscan,miRDB数据库共筛选出232个靶基因.GO功能分析显示38个富集,主要参与细胞-基质粘附的调节、细胞膜投射形态发生、β-连环蛋白结合等过程.KEGG分析显示4个相关通路:Hedgehog信号通路、寿命调节通路、雌激素信号通路、松弛素信号通路.生存分析结果显示,食管鳞癌中与患者生存相关的差异lncRNA包括LINC00261、MLIP-IT1、LINC00504,差异miRNA包括hsa-mir-338,未发现与生存相关的mRNA.食管腺癌中与生存相关的差异lncRNA包括CYP1B1-AS1、HOTAIR,差异mRNA包括IL11、NTRK2、ANGPT2、PBK.食管鳞癌和腺癌共有的差异lncRNA上调占15.4％(150个),下调占26.8％(158个);miRNA上调占24.2％(22个),下调占27.6％(8个);mRNA上调占20.5％(234个),下调占23.7％(418个).结论 食管鳞癌和腺癌存在明显的分子差异,lncRNA、miRNA及mRNA有望为食管癌的治疗和预后预测提供新的靶点与分子标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马军	郑州大学第二附属医院消化疾病研究所	91	332	8.0	12.0
2	王健	郑州大学第二附属医院肿瘤科	36	127	6.0	9.0
3	李南	郑州大学第二附属医院肿瘤科	19	98	5.0	9.0
4	孙金旗	郑州大学第二附属医院检验科	12	31	2.0	5.0
5	张亚丽	郑州大学第二附属医院消化疾病研究所	13	21	3.0	4.0
6	马佳康	郑州大学第二附属医院肿瘤科	9	9	2.0	2.0
7	任凯凯	郑州大学第二附属医院肿瘤科	8	9	2.0	2.0
8	李雨濛	郑州大学第二附属医院肿瘤科	8	31	2.0	5.0