大鼠脊髓损伤后脊髓组织中上调差异基因的生物信息学分析

• 作者: 于海艳 刘伟伟 夏军 张晓 易晓红 薛清彩 钟占琼 陈继兰 黄聪
• 来源期刊: 中国康复理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 脊髓损伤 上调基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 专题 脊髓损伤机制及并发症的康复
• 页码范围: 621-629
• 页数: 9页
• 分类号: R651.2
• 字数: 7254字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-9771.2019.06.001

摘要

目的 探究大鼠脊髓损伤后脊髓组织中差异表达的上调基因及功能.方法 采用改良Allen法制备雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型,应用基因芯片技术检测在大鼠脊髓损伤后脊髓中差异基因的变达,运用基因本体论和基因组百科全书数据库分析差异上调基因、功能定位与通路.结果 脊髓组织总核糖核酸质量检测结果合格;基因芯片检测结果显示上调差异基因1874个,下调差异基因2348个;生物信息学分析上调差异基因的生物学过程、细胞组分和分子功能,涉及凋亡、免疫反应、炎症等,通路分析主要涉及磷脂酰肌醇三激酶-蛋白激酶B信号通路和Toll样受体信号通路等.结论 脊髓损伤后,上调差异表达基因可能参与脊髓损伤后的继发性反应,如炎症、免疫应答、缺氧等,继而影响脊髓损伤后的运动功能和感觉功能.