狗枣猕猴桃AkSAP蛋白的生物信息学分析

• 作者: 刘丹 李然红 王立凤 陈鑫
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 狗枣猕猴桃 锌指蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 103-108
• 页数: 6页
• 分类号: S663.4
• 字数: 3415字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.12.015

摘要

为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkSAP)的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测.结果表明,AkSAP的cDNA全长为2089 bp,编码区(CDS)为1431 bp,编码蛋白为由477个氨基酸构成的非稳定亲水蛋白,属于SAP蛋白家族成员(ID:10488483),主要构件为 α-螺旋和不规则卷曲,包含锌指蛋白特有的SAP结构域,与其他17种植物的SAP氨基酸序列进行对比,与中华猕猴桃变种亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈鑫		46	105	6.0	8.0
2	刘丹		48	70	5.0	7.0
3	李然红		44	101	6.0	8.0
4	王立凤		43	100	6.0	7.0