2014-2017年中国部分地区PEDV流行株S基因遗传进化分析

• 作者: 乔涵 张鸿鑫 赵宇 郑慧华 陈红英 韩昊莹
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: PEDV S基因 遗传进化分析 变异
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 249-255
• 页数: 7页
• 分类号: S858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20190320.008

摘要

参考GenBank中PEDV经典CV777毒株基因组序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法对临床采集的疑似PEDV样品进行S基因扩增、克隆和测序,拼接获得30条完整S基因序列,并进行遗传进化及同源性分析.结果 显示,获得的30条PEDV S基因与25个参考株S基因的核苷酸相似性介于93.6％～99.8％;且各流行毒株与经典毒株比较,具有多处的点突变、插入和缺失.与其他参考株相比,S1区存在157个氨基酸突变位点,占总数的65.7％ (157/239),暗示PEDV的S1区域比S2区域易发生变异;表明目前中国PEDV流行株已经发生了变异,在一定程度揭示了免疫猪群仍然发病的原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈红英	河南农业大学牧医工程学院	168	646	12.0	16.0
3	张鸿鑫	河南农业大学牧医工程学院	12	30	3.0	5.0
6	乔涵	河南农业大学牧医工程学院	17	49	4.0	5.0
7	韩昊莹	河南农业大学牧医工程学院	19	36	4.0	5.0
8	赵宇	河南农业大学牧医工程学院	21	81	5.0	8.0
9	郑慧华	河南农业大学牧医工程学院	14	19	3.0	4.0