深圳市HIV-1主要流行株外膜蛋白V3环氨基酸变异分析

• 作者: 何晓茜 廖清华 张燕 杨峥嵘 石向东 赵广录 赵锦 陈琳
• 来源期刊: 中国热带医学
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 亚型 外膜蛋白 变异
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 638-641
• 页数: 4页
• 分类号: R512.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2019.07.09

摘要

目的 了解深圳市HIV-1主要流行株膜蛋白V3环氨基酸变异情况.方法 收集深圳市1996-2010年HIV确认阳性样本389份,应用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)技术,对样本膜蛋白(Env)基因V3-V4区进行扩增,并对核苷酸序列进行测定,判定亚型结果.对获得的CRF01_AE、CRF_BC、B'和B重组株/亚型的核酸序列进行比对和翻译,分析其V3环氨基酸变异情况.结果 227例CRF01_ AE重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(184/227,811％),199例(87.7％)可预测使用CCR5辅助受体,12例(5.3％)使用CXCR4辅助受体;55例CRF_BC重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(54/55,98.2％),50例(90.9％)可预测使用CCR5辅助受体,5例(9.1％)不能预测;49例B'亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(39/49,79.6％),25例(51.0％)可预测使用CCR5辅助受体,3例(6.1％)使用CXCR4辅助受体,21例(42.9％)不能预测;10例B亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(5/10,50.0％),8例(80.0％)可预测使用CCR5辅助受体,2例(20.0％)使用CXCR4辅助受体.CRF01_AE、CRF_BC、B'和B亚型毒株V3环净电荷数分别为3.29±0.97(n=227)、3.11 ±0.42(n=55)、3.73±0.93(n=49)和3.50±0.97(n=10).结论 深圳市H1V-1 V3环顶端四肽主要为GPGQ和GPGR,病毒辅助受体使用以及表型预测结果表明深圳市HIV-1的流行仍以复制速度较慢的非合胞体诱导型病毒为主.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈琳		60	488	11.0	18.0
2	石向东		49	367	11.0	15.0
3	赵锦		42	260	10.0	14.0
4	杨峥嵘		24	92	6.0	7.0
5	赵广录		13	40	4.0	6.0
6	张燕		29	120	7.0	8.0
7	廖清华		6	6	1.0	2.0
8	何晓茜		2	5	1.0	2.0