三角褐指藻GPAT生物信息学及表达差异分析

• 作者: 俞凯 尹航 王何瑜 石慧 章丽 袁岚瑛 龚一富
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 三角褐指藻 甘油-3-磷酸酰基转移酶 基因表达 脂质
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1483-1489
• 页数: 7页
• 字数: 5781字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.08.1483

摘要

三羧酸甘油酯(TAG)是植物细胞中油脂的主要储存形式,甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)是TAG生物合成过程中的第1个限速酶.为探明三角褐指藻油脂含量变化与GPAT基因表达量之间的关系,本研究利用转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR技术克隆了三角褐指藻GPAT的cDNA全长,并对其进行生物信息学分析;通过RT-qPCR研究不同光照强度和温度下三角褐指藻GPAT的表达差异及总脂含量.结果 表明,三角褐指藻GPAT的cDNA全长序列为1 743 bp,含有1个长度为1 305 bp的ORF,编码434个氨基酸,含有3个保守序列区.保守结构域分析表明,三角褐指藻GPAT属于LPLATs超家族,且具有GPAT特征性的酰基结合位点.系统进化分析表明,三角褐指藻GPAT与大洋洲海链藻的亲缘关系最近.RT-qPCR结果显示,随着光照强度和温度的提高,三角褐指藻GPAT表达量均呈先上升后下降的趋势,且在25℃、37.5 μmol· m-2·s-1时达到最大值,与藻体内总脂含量变化趋势一致;此外,GPAT表达量与总脂含量随着温度的变化呈显著正相关(r=0.980,P＜0.05),推测三角褐指藻GPAT可能是三角褐指藻脂类代谢途径的关键基因.本研究为今后利用基因工程手段提高植物体内油脂含量提供了优质的基因资源,同时为进一步揭示三角褐指藻脂类物质合成的分子调控机制奠定了一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石慧	宁波大学法学院	19	97	6.0	9.0
2	龚一富	宁波大学海洋学院	54	342	11.0	16.0
3	王何瑜	宁波大学海洋学院	29	117	5.0	9.0
4	俞凯	宁波大学海洋学院	12	35	3.0	5.0
5	章丽	宁波大学海洋学院	13	82	4.0	9.0
6	尹航	宁波大学海洋学院	2	3	1.0	1.0
7	袁岚瑛	宁波大学海洋学院	1	0	0.0	0.0