大花杓兰亲环素基因(CmCyP)的克隆及生物信息学分析

• 作者: 付亚娟 侯晓强 刘欢 张剑
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 大花杓兰 RT-PCR 基因克隆 系统发育树 序列分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理生态与分子生物学
• 页码范围: 633-640
• 页数: 8页
• 分类号: Q949.95
• 字数: 4061字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201803035

摘要

亲环素是一个多基因家族,在植物生命活动中发挥着重要的作用.该研究以大花杓兰(Cypripedium macranthum)为材料,采用RT-PCR技术克隆到1个亲环素基因(CyP),并对其进行生物信息学分析.结果表明:大花杓兰CyP基因的开放阅读框序列为525 bp,命名为CmCyP(GenBank登录号为MH411125),编码174个氨基酸.预测CmCyP蛋白是一个位于细胞质、相对分子量约为18 kD、理论pI为8.73、无信号肽、跨膜结构域的亲水性蛋白质.磷酸化和糖基化位点预测分析发现,CmCyP蛋白存在18个潜在的磷酸化位点和2个潜在的糖基化位点.蛋白保守结构域预测分析发现,CmCyP蛋白包含一个高度保守的肽脯氨酰顺反异构酶结构域,属于单结构域亲环素.对二级结构进行预测分析发现,CmCyP蛋白中存在无规卷曲70个、延伸链56个、α-螺旋23个、β-折叠25个,这4种结构元件在三级结构中也有体现.系统进化树结果显示,大花杓兰CmCyP蛋白与铁皮石斛(Dendrobium catenatum)和万带兰(Vanda hybrid cultivar)的CyP蛋白的亲缘关系较近.该研究首次克隆了大花杓兰亲环素基因(CmCyP),为进一步探讨CmCyP基因的生物学功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张剑		18	37	4.0	5.0
2	付亚娟	廊坊师范学院生命科学学院	14	13	2.0	3.0
4	侯晓强	廊坊师范学院生命科学学院	20	49	4.0	6.0
10	刘欢	廊坊师范学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0