球孢白僵菌基因组候选效应子的预测与分析

• 作者: 林桂文 林进添 罗梅 董章勇
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 球孢白僵菌 效应子 全基因组 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 680-686
• 页数: 7页
• 字数: 3727字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.04.0680

摘要

球孢白僵菌(Beauveria bassiana)是一种广泛应用的生防菌株,效应子在其对寄主昆虫侵染过程中发挥着重要作用.为高通量地筛选球孢白僵菌的效应子,本研究根据球孢白僵菌全基因组信息,利用SignalP、TMHMM、TargetP和Protcomp等生物信息学软件和预测程序对球孢白僵菌中10 364个蛋白序列进行分泌蛋白预测.结果 表明,共分析到940个分泌蛋白,包含了185个碳水化合物活性酶家族蛋白.其中碳水化合物结合模块(CBM)40个,碳水化合物酯酶(CE) 23个,糖苷水解酶(GH)92个,糖基转移酶(GT)4个,多糖裂解酶(PL)2个,辅助功能酶(AA)24个.进一步将上述分泌蛋白与胞外酶数据库进行比对分析、半胱氨酸含量分析、多个串联重复序列分析、病原寄主互作数据库进行比对及剔除大于300个氨基酸序列的蛋白,共获得18个候选效应子,其中11个为功能未知的假定蛋白,其余为胞外蛋白、细胞壁蛋白、几丁质酶蛋白等.本研究结果为进一步探究效应子在病原菌与昆虫寄主中的互作奠定了理论基础,并为其他病原菌效应子的预测及分析提供了技术参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林进添	仲恺农业工程学院农业与生物学院	61	868	15.0	27.0
2	罗梅	仲恺农业工程学院农业与生物学院	32	136	7.0	11.0
3	董章勇	仲恺农业工程学院农业与生物学院	26	115	7.0	10.0
4	林桂文	仲恺农业工程学院农业与生物学院	1	2	1.0	1.0