藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析

• 作者: 余春林 徐亚欧 李志雄 杨朝武 林亚秋 江明锋 蒋小松 袁茂
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 藏鸡 肌肉发育 转录组 miRNA
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 2400-2412
• 页数: 13页
• 分类号: S831.2
• 字数: 7185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.12.004

摘要

旨在从转录组和 miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制,了解藏鸡肌肉发育的特殊性.本研究对 120和 150 日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和 small RNA测序,筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和 miRNA,并利用 qRT-PCR技术对测序结果进行验证.结果,共筛选出 1 691个差异表达基因,其中上调基因 330个,下调基因1 361个.差异表达 miRNA共有 22个,其中 9个上调,13个下调.随机选择的 5个基因和 miRNAs的 qPCR验证结果表明表达趋势与测序结果一致.GO富集分析显示,在富集前 10的条目中,与免疫相关的条目占较大比例.KEGG分析结果显示,在 19个显著富集通路中,与免疫相关的通路占较大比例,且 83个 miRNA的靶基因出现在显著富集通路上.转录组和 small RNA测序数据联合分析表明,343个 miRNA-mRNA对为负相关调控模式.本研究从多组学层面为进一步理解藏鸡的肌肉发育提供了理论基础.