SRA数据库架构及二代测序数据共享

• 作者: 吕军 张军 李瑞华 李豹 田国祥 郭晓娟
• 来源期刊: 中国循证心血管医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: SRA数据库 二代测序 数据提取
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 循证研究与临床转化·方法学
• 页码范围: 1281-1284
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 2393字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4055.2019.11.01

摘要

近年来,随着二代测序技术的迅猛发展,高通量测序数据也呈指数级增长,SRA (Sequence Read Archive)数据库是用于存储这些二代测序原始数据和比对信息的代表性数据库.SRA数据库建立至今,各项测序数据迅速累积,已囊括多个物种、多种应用,成为大规模二代测序数据库及高效率的测序数据存储、提取及共享的平台.该数据库目前持续更新并面向公众开放.本文将介绍SRA数据库的网站架构及测序原始数据提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张军	西安交通大学医学部公共卫生学院	237	1613	19.0	29.0
2	田国祥	解放军总医院第七医学中心干四科	24	16	2.0	3.0
3	郭晓娟	西安交通大学第一附属医院神经内科	19	139	6.0	11.0
4	李豹	西安交通大学医学部公共卫生学院	10	21	3.0	4.0