罗氏沼虾转录组免疫相关SNP的挖掘与分析

• 作者: 唐修阳 欧江涛 王传聪 王资生 项杰
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 罗氏沼虾 转录组 SNP 高通量测序技术 免疫 抗病
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医与水产蚕桑
• 页码范围: 145-148
• 页数: 4页
• 分类号: S942.5
• 字数: 2523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.04.035

摘要

为了挖掘罗氏沼虾免疫相关单核苷酸多态性(SNP),采用第二代高通量测序技术,对罗氏沼虾的肝胰腺进行转录组深度测序分析.结果发现SNP位点37589个,其中转换25188个,颠换12401个.再对SNP所在的基因进行GO(gene ontology)分类和KOG注释,分别筛选到2451个有GO注释和2458个有KOG注释的SNP,并重点对4个重要免疫通路的145个免疫相关基因,筛选出129个SNP位点.相关研究结果将为进一步系统挖掘免疫相关SNP的分子遗传标记奠定基础,为罗氏沼虾疾病防控和选育抗病新品种提供科学参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王资生	盐城工学院海洋与生物工程学院	27	301	9.0	17.0
2	欧江涛	盐城工学院海洋与生物工程学院	7	8	2.0	2.0
3	唐修阳	盐城工学院海洋与生物工程学院	2	5	1.0	2.0
4	王传聪	盐城工学院海洋与生物工程学院	2	5	1.0	2.0
5	项杰	盐城工学院海洋与生物工程学院	2	5	1.0	2.0