植物miR399家族分子特征及靶基因功能分析

• 作者: 代冬琴 刘潮 唐利洲 褚洪龙 陈欢欢 韩利红
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: miR399 进化 靶基因 磷胁迫
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q789
• 字数: 4853字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751113

摘要

为研究植物miR399家族成员构成、分子特征及其靶基因功能,利用生物信息学方法对植物miR399家族成员数量、系统进化、二级结构、启动子特征及靶基因功能进行分析.共获得244个成熟miR399成员,仅分布在被子植物中,不同物种中pre-miR399和miR399的数量分布差异较大;大多数pre-miR399仅剪切为单个成熟miR399,数量最多的pre-miR399长度为64 nt,93.85％ 的成熟miR399序列长度为21 nt;pre-miR399序列分析显示,3′端保守性高于5′端,且大部分成熟miR399序列来源于3′端,保守序列为UGCCAAAGGAGA?UUGCCC?G;进化分析显示,miR399序列一致性较高,但不同种属间聚类关系较复杂;植物pre-miR399主要分为3种类型:①产生1条成熟miR399,且位于pre-miR399的3′端;②产生2条成熟miR399,分别位于pre-miR399的3′端和5′端;③产生1条成熟miR399,且位于pre-miR399的5′端;pre-miR399启动子区含有大量激素和胁迫响应元件;水稻miR399家族靶基因本体分析显示,细胞组分分类中的细胞和细胞部分类别占比均为59.1％,分子功能分类中的催化活性和结合类型占比分别为40.9％ 和45.5％,miR399调控了多个磷响应和磷转运靶基因,这些基因主要参与了植物磷代谢、应激响应、基因表达调控等多项进程.研究表明,miR399在植物进化过程中高度保守,能够响应多种不同信号,其参与了植物的多种生命过程,尤其在植物磷饥饿胁迫和磷转运中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩利红	曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心	30	60	5.0	6.0
2	刘潮	曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心	34	91	6.0	8.0
3	唐利洲	曲靖师范学院 云南高原生物资源保护与利用研究中心	12	21	3.0	4.0
4	褚洪龙	曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心	2	1	1.0	1.0
5	代冬琴	曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心	2	1	1.0	1.0
6	陈欢欢	曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心	1	1	1.0	1.0