甜菜夜蛾核多角体病毒VP39基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 姜玉霞 李萌 李赛男 赵海洲
• 来源期刊: 重庆理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 甜菜夜蛾核多角体病毒 Sevp39 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 药学·生物工程
• 页码范围: 190-197
• 页数: 8页
• 分类号: Q785
• 字数: 4001字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8425(z).2019.08.030

摘要

VP39是杆状病毒核衣壳主要结构蛋白基因,为研究VP39在杆状病毒生活周期中的可能作用,用PCR方法克隆得到甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodoptera exigua multicapsid nucle-opolyhedrovirus,SeMNPV)VP39全长基因(Sevp39),将其克隆至pMD18-T载体上,获得重组质粒T-Sevp39,进行序列测定和生物信息学分析.序列测定结果表明:扩增序列大小为981bp,与GenBank登录序列(Genbank accession No.NC_002169)核苷酸同源性99.9％,第308位的碱基由G突变成T.序列分析表明:Sevp39编码蛋白(Sevp39)有多个可能的N-糖基化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个N-豆蔻酰化位点.蛋白序列比对结果表明:Sevp39与绝大部分杆状病毒VP39的序列相似性均大于30％,在Sevp39同源蛋白中有6个高度保守的半胱氨酸残基(Cys).蛋白质二级结构预测结果显示:Sevp39可能形成7个α螺旋和14个β折叠,高度保守的Cys17参与了β折叠的形成.上述结果为研究Sevp39在病毒入侵和病毒复制过程中所担负的功能奠定了实验基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赛男	肇庆学院生命科学学院	16	20	3.0	4.0
2	姜玉霞	肇庆学院生命科学学院	22	30	3.0	3.0
3	李萌	肇庆学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0
4	赵海洲	肇庆学院生命科学学院	8	12	2.0	3.0