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利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记
利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记
作者:
丛玲
张丽霞
朱振兴
王平
王春语
陆晓春
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
高粱
SSR
重测序
多态性引物
分子标记
摘要:
SSR分子标记由于具有成本低廉、容易操作等特性,使其在分子标记辅助育种中广泛应用.目前高粱SSR标记多基于测序已经完成美国高粱品种BTX623基因组开发,在应用中筛选多态性标记的效率低.对不育系和恢复系组成的26个高粱材料进行了重测序,然后进行生物信息学分析,最终开发了在26份材料中至少含有2种多态型的SSR标记24441个.这些SSR标记在26份材料中表现出的基因型多态类型在2-7种之间,2种的有16694个,7种的仅有77个.另外本研究还进行了筛选单拷贝基因处的多态性SSR分析,共筛选到6733个.随机挑选均匀覆盖10条染色体的单拷贝基因处SSR标记50对,利用辽宁高粱杂交种辽糯3号进行测试,其中49对能扩增出产物,成功率高达98%.其后利用2个品种和74份微核心种质资源测试表明,50对SSR标记在2个品种中有18对表现出多态性,挑选了一对引物在74份微核心种质中可见8种多态型.本研究表明利用不育系和恢复系材料进行重测序能有效开发多态性高的SSR标记.
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文献信息
篇名
利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记
来源期刊
生物技术通报
学科
关键词
高粱
SSR
重测序
多态性引物
分子标记
年,卷(期)
2019,(11)
所属期刊栏目
技术与方法
研究方向
页码范围
217-223
页数
7页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0692
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王平
辽宁省农业科学院高粱研究所
59
368
11.0
15.0
3
王春语
辽宁省农业科学院高粱研究所
16
54
4.0
7.0
6
张丽霞
辽宁省农业科学院高粱研究所
17
64
4.0
7.0
7
丛玲
辽宁省农业科学院高粱研究所
14
57
4.0
7.0
8
朱振兴
辽宁省农业科学院高粱研究所
9
35
3.0
5.0
9
陆晓春
辽宁省农业科学院高粱研究所
6
10
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(63)
参考文献
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节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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参考文献(1)
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参考文献(2)
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参考文献(1)
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2019(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
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节点文献
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SSR
重测序
多态性引物
分子标记
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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