类乌齐牦牛SIRT3基因克隆与生物信息学及差异表达分析

• 作者: 信金伟 姬秋梅 杨玉梅 柴志欣 王会 王吉坤 钟金城
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 类乌齐牦牛 SIRT3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 56-62
• 页数: 7页
• 分类号: S823.2
• 字数: 5735字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2019-06-056

摘要

本实验旨在丰富牦牛SIRT3基因的基础研究,通过对西藏类乌齐牦牛SIRT3基因克隆、生物信息学分析及差异表达分析,进一步探讨SIRT3基因的生理功能及分子机制.结果 表明:类乌齐牦牛SIRT3基因CDS区长1 002 bp,编码333个氨基酸,与普通牛SIRT3基因CDS区比对存在碱基突变,编码氨基酸发生错义和同义突变,同义突变发生在碱基第49、279、342、384位,错义突变发生在碱基第149和620位,其编码蛋白属亲水性蛋白,有多个跨膜区域和磷酸化位点,无信号肽片段,主要位于线粒体,二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主;SIRT3基因编码蛋白在催化活性、核苷酸结合及辅因子结合等过程发挥主要功能,主要参与生物体代谢过程;类乌齐牦牛SIRT3基因序列与普通牛一致性较高,亲缘关系最近;QPCR分析显示,SIRT3基因在牦牛肝脏中的表达水平极显著高于其他组织(P＜0.01).