皱皮香猪3个基因组拷贝数变异的多态性分布

• 作者: 冉雪琴 李升 牛熙 王嘉福 王州 黄世会
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 皱皮香猪 拷贝数变异 多态性 皮肤 剂量效应
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 31-38
• 页数: 8页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4673字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2019-06-031

摘要

为探究皱皮香猪个体产生皮肤变异的根本原因,本文基于重测序数据,采用生物信息学分析皱皮香猪基因组中的拷贝数变异(CNV),通过荧光定量PCR方法检测皱皮香猪中3个CNVs的拷贝数变异规律,并与香猪和大白猪进行比较.结果 表明:3个CNVs在猪群中的拷贝数变异呈现出多态性变化,皱皮香猪中CNV1以拷贝数缺失型为主,其中的MPC1和RSK3基因可能与脂肪沉积有关;皱皮香猪CNV2和CNV3以拷贝数增加型占优势,其中的CCL17和CX3CL1基因参与皮肤等组织的炎症反应,可能通过剂量效应引起香猪皮肤产生褶皱.