16S rRNA基因测序分析技术在食品污染菌监测中的应用

• 作者: 何娇明 刘楚云 张祥 段永翔 胡鹏威 袁月明 袁梦
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 食品监测 食源性致病菌 16S rRNA 基因测序 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 2028-2031,2101
• 页数: 5页
• 分类号: R117
• 语种: 中文

摘要

目的 将16S rRNA基因测序分析技术应用于食品安全风险监测中非目标(相似、少见或非典型)致病菌的鉴定,为食源性疾病防控提供更多病原学证据.方法 采集18份畜类、18份禽类和9份鱼类共45份生鲜样品,目标致病菌按照GB4789标准检测,非目标菌进行16S rRNA基因测序,将全长序列在GenBank中比对确定细菌种属,通过MEGA6构建细菌16S rRNA基因进化树,判定细菌种属间的亲缘关系.结果 45份生鲜样品中检出19株目标致病菌,包括沙门氏菌、空肠弯曲菌、单增李斯特菌和副溶血弧菌,而34株非目标菌16S rRNA基因全长序列能分别比对出13种细菌,其中8种19株菌属于致病或条件致病菌,包括霍乱弧菌、溶藻弧菌、结肠弯曲菌、奇异变形杆菌、粪肠球菌和铜绿假单胞菌,以及在深圳乃至省内首次报道的布氏弓形菌和海藻希瓦氏菌.结论 深圳市售生鲜食品受到多种食源性致病菌污染,特别是非目标检出的致病菌,对此认为16S rRNA基因测序分析技术是一套有效的细菌监测适宜技术,能提高食源性疾病和食物中毒的防控水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁梦	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	45	171	8.0	10.0
2	袁月明	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	33	124	6.0	9.0
3	刘楚云	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	14	36	4.0	5.0
4	胡鹏威	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	8	13	3.0	3.0
5	何娇明	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	1	1	1.0	1.0
6	张祥	深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科	1	1	1.0	1.0