不同阶段阿尔茨海默病患者海马CA1区基因表达的生物信息学分析

• 作者: 余婧萍 宋祯彦 成绍武 李富周 贺春香 陈易璇
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 阿尔兹海默 GEO数据库 基因表达 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 专题讨论一:中医情志病与脑稳态调控研究进展-第二届“中医脑科学大会”优秀论文(一)
• 页码范围: 1791-1798
• 页数: 8页
• 分类号: R34
• 字数: 5236字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20190529004

摘要

目的 对不同阶段阿尔茨海默病海马CA1区差异表达的基因进行生物信息学分析以探究阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)发生的分子机制.方法 从GEO数据库获取AD早期、中期、晚期基因芯片数据,筛选3个时期都具有的显著差异表达的基因,构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,利用cytoNCA获取关键基因并进行细胞实验验证,同时分析这些关键基因参与的主要生物学过程和信号通路富集程度,以探究其分子机制.结果 从AD不同阶段的基因芯片(GSE28146)中筛选出在不同时期均出现差异表达的基因412个,使用STRING构建PPI网络关系,cytoNCA构建并结合网络拓扑分析,共筛选出关键基因12个,qPCR验证了芯片结果 的准确性;GO和Pathway富集分析显示与一氧化氮合酶活性的调节、细胞凋亡、缺氧反应、神经炎症等生物学过程密切相关,主要涉及的信号通路有Rap1、Ras、NF-κB、TNF、PI3K-Akt.结论 本研究发现神经炎症相关的基因和信号通路的失调可能是导致AD发生的重要因素,它们可能是防治AD的潜在生物标志物或药物靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	成绍武	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	68	119	4.0	10.0
2	宋祯彦	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	36	33	4.0	4.0
3	贺春香	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	6	0	0.0	0.0
4	余婧萍	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	9	6	2.0	2.0
5	李富周	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	5	9	2.0	3.0
6	陈易璇	湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室	5	6	2.0	2.0