两种HLA分型方法对比

• 作者: 原应博 方铭
• 来源期刊: 现代畜牧科技
• 学科: 生物学
• 关键词: HLA分型 polysolver 分型新方法 高通量测序数据
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 研究与综述
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: Q81
• 字数: 5141字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19369/j.cnki.2095-9737.2019.08.001

摘要

对比两种HLA分型方法的准确率,通过使用polysolver方法和研究出的新方法这两种方法对100个个体的全基因组外显子测序数据(WES)进行分型,然后将两种方法的分型结果与这100个个体的sanger一代测序结果进行比较,找到新方法的优点和不足,并且为动物MHC基因研究提供算法基础.经过新方法的开发以及优化,最终与polysolver方法的结果进行比较,得出结论,发现研究的新方法与polysolver分型方法相比准确率相对较高,且运行时间相对较短.两种方法均只能对HLA一类分子进行分型,这一点在将来实验中会进一步改进.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方铭		3	0	0.0	0.0
2	原应博		1	0	0.0	0.0