树鼩肠道菌群多样性与功能预测研究

• 作者: 曹雪 李波 杨学芳 王利梅 郑红
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 树鼩 肠道菌群 16SrRNA 菌株功能
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 101-103,113
• 页数: 4页
• 分类号: S852.21
• 字数: 3316字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2019.08.026

摘要

[目的]鉴定树鼩的肠道菌群,分析树鼩肠道菌群多样性和丰度,并进行菌群功能预测.[方法]随机采集3份雄性树鼩粪便样品,提取树鼩粪便中细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得16S rRNA V3～V4片段,采用高通量Illumina PE300平台进行测序,利用BIPES以及QIIME分析并比较菌群结构及多样性.最后,通过PICRUS t软件对肠道菌群的功能进行预测.[结果]树鼩肠道粪便细菌有9门20纲33目53属122种208个OTU.门水平上,优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria);属水平上,埃希氏杆菌属(Escherichia)、乳酸菌属(Lactobacillus)和肠球菌属(Enterocossus)为优势菌群.PICRUS t功能预测结果表明,肠道细菌编码的大多数基因与代谢相关,其次是基因信息加工、环境信息加工.COG功能分类分析表明肠道微生物基因在"氨基酸的运输和代谢"和"碳水化合物运输与代谢"功能类群的相对丰度较高.[结论]PICRUS t功能预测到树鼩肠道菌群主要与代谢相关,树鼩肠道菌群是研究肠道菌群与代谢类疾病的一种良好试验材料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨学芳	昆明医科大学科研实验中心	16	31	4.0	5.0
2	王利梅	昆明医科大学实验动物学部	25	42	5.0	5.0
3	李波	昆明医科大学研究生院	53	161	6.0	10.0
4	郑红	昆明医科大学实验动物学部	32	52	5.0	5.0
5	曹雪	昆明医科大学实验动物学部	4	2	1.0	1.0