大白菜ENT基因家族的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘振宁 庞文玉 杨宝谊 王安
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 核苷转运蛋白 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 52-57
• 页数: 6页
• 分类号: S634.101
• 字数: 3602字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.12.010

摘要

核苷转运蛋白(nucleoside transporter,ENT)是一类具有跨膜运输核苷和核苷类似物的功能蛋白.为深入研究大白菜ENT基因家族的功能,利用生物信息学方法对大白菜基因组中的ENT基因家族成员进行鉴定,并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域、系统进化树等方面进行了研究.结果表明,在大白菜基因组中共鉴定到12个ENT基因,通过系统发育树分析,可以将12个ENT基因分为2类;对大白菜ENT蛋白氨基酸序列多重比对和蛋白跨膜域的分析表明,BrENT蛋白存在11个跨膜域,为跨膜蛋白;通过MEME软件对大白菜ENT蛋白motif的预测还发现了14个比较保守的motif.染色体分析表明,ENT基因在大白菜10条染色体上不均匀分布,而且存在明显的串联重复现象,推测串联复制是ENT基因家族基因扩增的主要方式,研究结果为在基因组范围内研究ENT基因的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振宁	临沂大学农林科学学院	7	2	1.0	1.0
5	庞文玉	临沂大学农林科学学院	2	0	0.0	0.0
6	王安	临沂大学农林科学学院	3	2	1.0	1.0
7	杨宝谊	临沂大学农林科学学院	1	0	0.0	0.0