盐胁迫下比拉底白刺差异表达基因的转录组分析

• 作者: 夏新莉 尹丹丹 尹伟伦 成铁龙 田林
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 比拉底白刺 盐胁迫 转录组 差异表达基因 功能分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S722.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2020.01.001

摘要

[目的]为了挖掘比拉底白刺耐盐相关基因,对其盐胁迫下差异表达基因进行筛选分析.[方法]以比拉底白刺幼苗为材料,用200 mmol·L-1 NaC1对幼苗处理7d,并对胁迫处理和对照植株叶片进行转录组测序及生物信息学分析.[结果]有效序列组装共得到应答盐胁迫的168 463条unigenes和196个差异表达基因.通过差异基因GO和KEGG功能聚类,分别获得64个GO功能小类和25条KEGG通路.进一步基因相互作用网络分析发现,转录调控、氧化还原以及抗逆相关基因在比拉底白刺应答盐胁迫中发挥重要作用,其中,筛选到3个重要的节点基因,分别是热激同源蛋白基因、L型凝集素类受体激酶基因和Win类蛋白基因.[结论]本研究获得了盐胁迫下比拉底白刺的差异表达基因及功能注释信息,有助于理解其耐盐的分子机制,为后续开发耐盐分子标记及通过基因编辑改良植物耐盐特性提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尹伟伦	北京林业大学生物科学与技术学院	165	3260	31.0	50.0
2	夏新莉	北京林业大学生物科学与技术学院	77	1233	20.0	32.0
3	成铁龙	南京林业大学生物与环境学院	6	98	3.0	6.0
4	田林	北京林业大学生物科学与技术学院	3	21	1.0	3.0
8	尹丹丹	中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室	1	0	0.0	0.0